پژوهش و تحقیق ابزاری برای توسعه مرزهای دانش و دستیابی به فناوری های نوین و برتر است که به استقلال و شکوفایی صنعت منجر می شود. دستیابی به این مهم نیازمند داشتن بستر مناسب و برنامه ای از پیش تعیین شده است که در یک ساختار نظام یافته پژوهش محور موجبات تعالی علمی و پربارشدن درخت دانش در جامعه خواهد شد. معاونت پژوهشی دانشگاه آزاد اسلامی واحد مهدی شهر با هدف تولید علم و نهادینه کردن ارتباط صنعت و دانشگاه در راستای اعتلای میهن عزیزمان تمام عزم خود را معطوف محوری نمودن پژوهش و حمایت و هدایت دانش پژوهان و پیوند علم و عمل نموده است .اهم وظایف معاونت به شرح زیر است:
1- تدوین برنامه ها و نقشه جامع پژوهشی و فناوری
2- فراهم آوردن امکانات پژوهشی
3- انجام مطالعات در مورد ارزشیابی فعالیت های پژوهشی
4- فراهم کردن زمینه ارتباط با صنعت
5- جذب پروژه های تحقیقاتی و مطالعاتی و فنی از خارج دانشگاه
6- تشویق گروه های آموزشی به نشر کتب و مقالات علمی
7- ارتباط با سایر دانشگاه های داخلی و خارجی
8- ایجاد هسته های پژوهش مدار متشکل از اعضای هیات علمی در همه رشته ها
v دفتر طرح برنامه و بودجه
برای اعتلای علمی دانشگاه و دانشگاهیان وجود برنامه ای پویا به همراه تسهیلات کافی که موجب آسودگی خاطر و دلگرمی دانش پژوهان شود از ضروریات است. در این راستا اهم وظایف دفتر طرح برنامه و بودجه به شرح ذیل است :
1- تشویق اعضای هیات علمی و مدرسان به انجام امور پژوهشی و نشر مقالات علمی و چاپ کتب
2- حمایت از اعضای هیات علمی و مدرسان جهت ارائه مقاله در داخل و خارج از کشور
3- برنامه ریزی و پیگیری برگزاری نمایشگاه های علمی و فنی
4- ایجاد زمینه مساعد جهت تبادل تجربیات و اطلاعات و فنی بین دانشگاه ها و مراکز صنعتی
5- ترغیب گروه ها و ایجاد تسهیلات برای سمینارها و کارگاه های تخصصی و همایش های علمی
6- برنامه ریزی و ارائه خدمات آموزشی و طرحهای پژوهشی به ارگانهای دولتی و غیردولتی